Salut
En purée, en cubes, en frites... la pomme de terre est très populaire dans nos assiettes et facile à préparer... Mais pour les généticiens qui voulaient décoder son ADN, la recette n'était pas simple!
Quel organisme possède 39.000 gènes codant pour les protéines et quatre copies de chaque chromosome? Ce n’est certainement pas l’être humain puis que nous n’avons que 20.000 gènes et des chromosomes en deux exemplaires … Ce n’est ni un mammifère ni un autre animal… C’est la pomme de terre, Solanum tuberosum.
Le génome de ce tubercule très populaire dans le monde a enfin été décodé par un consortium regroupant 26 instituts de recherches (Potato Genome Sequencing Consortium). La pomme de terre résistait aux généticiens à cause de ses chromosomes en quatre exemplaires et des nombreuses variations entre les différentes copies.
Les travaux se sont donc concentrés sur une variété sud-américaine dont le génome est diploïde (2 copies) plutôt que tétraploïde (4 copies). Les chercheurs ont reproduit la moitié de ce génome afin d’avoir deux copies identiques (homozygote). Ils ont en parallèle séquencé une grande partie d’une autre variété diploïde avec un génome hétérozygote. Enfin ils ont eu recours aux dernières techniques de séquençage, qui ont grandement accéléré le traitement des données.
Quatrième denrée cultivée consommée au monde, après le riz, le blé et le maïs, la pomme de terre est importante pour la sécurité alimentaire mondiale. Un des objectifs du séquençage est donc de mieux la protéger contre les ravageurs et les maladies, comme le mildiou. Les chercheurs ont ainsi identifié plus de 800 gènes de résistance aux maladies qui pourraient permettre de développer de nouvelles variétés de pommes de terre, plus faciles à cultiver.
Ces travaux sont publiés cette semaine par la revue Nature (édition électronique anticipée du 10 juillet).
http://www.sciencesetavenir.fr/actualite/fondamental/20110711.OBS6893/le-genome-de-la-pomme-de-terre-sequence.html
Mar 12 Juil - 16:22