Hermann Junker (né le 29 novembre 1877 à Bendorf / Rhein, mort le 9 janvier 1962 à Vienne) est un égyptologue allemand.
Junker a étudié la théologie et l'égyptologie dont l'étude lui a permis en 1903 une thèse sur le thème Sur le système d'écriture dans le temple de Hathor à Dendérah à l'université de Berlin.
Entre 1909 et 1911 il conduit des fouilles scientifiques à el-Kubanieh (Nubie). Les résultats de ces travaux lui permettent sa nomination en 1912 à une chaire d'égyptologie à l'Université de Vienne. Toujours cette même année, Junker revient en Égypte, afin pendant deux ans, de participer à des travaux dans le cimetière et à l'ouest de la pyramide de Khéops à Gizeh, et, sous l'égide de l'IED, à explorer systématiquement les pyramides du plateau de Gizeh.
L'Académie autrichienne des sciences l'admet en 1919 et, deux ans plus tard, il devient le doyen de la faculté des lettres de l'Université de Vienne. En tant que tel, Junker a été déterminant à la création de l'Institut d'égyptologie en 1923 à cette université.
De 1925 à 1935, il prend la direction du SIG au Caire ; au cours de ces années, il enseigne, en tant que professeur d'égyptologie, à l'université Fouad (devenue Université du Caire). De 1931 jusqu'aux événements politiques de mars 1938, il est professeur honoraire à l'Université de Vienne. Après la Deuxième Guerre mondiale, il a de nouveau ce poste de professeur honoraire, qu'il occupe jusqu'en 1953.
Hermann Junker décède le 9 janvier 1962 à Vienne, à l'âge de 85 ans.
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